/摘要： 一家大型基因测序功能公司每日会产生10TB到100TB的下机数据，大数据生信分析平台需要达到PB级别的数据处理能力。这背后是生物科技和计算机科技的双向支撑：测序应用从科研逐步走向临床应用，计算模式从离线向在线演进，交付效率越来越重要。作者李鹏，原文首发于InfoQ，《容器混合云，Kubernetes...

相似基因       很好的题解 1.dp基本思路dp题基本这么几个步骤： 定义状态。写出状态转移式。根据状态转移式找出递推顺序。处理递推的边界。找出结果。 我讲解时不会就题论题，而是讲大部分黄绿难度的dp题的方法。&n...

大家都知道，基因可以看作一个碱基对序列。它包含了4种核苷酸，简记作A,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能，以利用于诊断疾病和发明药物。在一个人类基因工作组的任务中，生物学家研究的是：两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。两个基因的相似度的计算方法如下：对于两个已知基因，例如AGTG...

  今年A股市场上手游概念股的表现可谓“独当一面”，不少和手游沾边的公司股价都翻了倍。在笔者看来，这些手游企业的股价明显高得离谱，这轮行情可以证明资本市场对手游的关注度非常高，但并不意味着这些手游企业就能一帆风顺，因为除传统手游企业以外，不少互联网巨头也对该领域虎视眈眈。&n...

　　给出两个长度为5*n的序列，每个序列中，有1~n各5个。　　求其最长公共子序列长度。 　　我们发现这题的序列特殊性是关键！　　我们只需要知道每一种数字在某一个序列中的5个位置，然后对于普通的LCS问题，我们只有在a[i]=b[j]的时候才会+1。　　那么我们可以维护一个树状数组，在a序列中，我们一个一个位...

 考虑到cnblog不适合基因组领域这种类型的文章，最终，我自己开通了公众号：碱基矿工，欢迎感兴趣的同学关注！也可以关注我的知乎：https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改：这篇文章写于2013年，首发在cnblog上，目...

基因组学技术新进展与展望于军  任鲁风 王绪敏（中国科学院北京基因组研究所）近十年来，由“下一代测序（nextgenerationsequencing;NGS）”技术引领的基因组科学与技术正在一个空前的高速度推动下迅猛发展。这个发展势头的加速度之高，其研究成果在生物...

什么是基因的可变剪切？有些基因的前体mRNA（pre-mRNA）通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的mRNA剪接异构体，这一过程称为可变剪接（或者选择性剪切）（AlternativeSplicing）。常见的可变剪切可以分成6类：1、外显子跳跃（ExonSkipping）2、内含子保留（IntronRet...

HGNC全称为HUGOGeneNomenclatureCommittee,叫做HUGO基因命名委员会，负责对人类基因组上包括蛋白编码基因，ｎｃＲＮＡ基因，甲基因和其他基因在内的所有基因提供一个唯一的，标准的，可以广泛传播的symbol; 数据库的主页为　http://www.genenames.org/对于每...

admin 2015年8月11日未分类 评论 13查看 花1000美元就能为个人基因组测序，这是10多年来许多基因组测序公司奋斗的目标。现在，美国Illumina公司宣布，他们已能够使这一愿望成为现实。位于圣迭戈的Illumina公司本周发布消息说，将推出一款叫做HiSeqXTe...

原文网址：http://blog.biochen.com/archives/337 HISAT2是TopHat2/Bowti2的继任者，使用改进的BWT算法，实现了更快的速度和更少的资源占用，作者推荐TopHat2/Bowti2和HISAT的用户转换到HISAT2。官网：https://ccb.jhu.edu...

annovar一般只包含人类基因组注释数据库，其他的物种如小鼠需要自己进行建立注释信息。第一步：下载annovar软件上Annovar官网下载（http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/），现在要邮件注册后才能下载。邮件注册后...

   编程界的新宠Julia发布1.0正式版本，多种优势集于一身2018-08-1414:14公司Julia的累积下载次数超过200万，已被应用于自动驾驶汽车、机器人、3D打印、精准医疗、增强现实、基因组学、能源交易、机器学习、金融风控和太空任务设计等多个领域。此次Julia1.0版本的发...