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CNV

CNV:人类主要是二倍体。如果有些区域出现3个、4个拷贝,那就是扩增了,如果只出现1个拷贝,就是缺失。所以CNV分析是依靠特定位置的测序深度来估算的,先在染色体上划窗,然后看每个窗口的平均测序深度,如果连续多个窗口的测序深度在样品/对照中都有差异,那么就判断为CNV,标准是拷贝数相除,然后取log2,log2Ratio...
代码星球 ·2020-04-15

DNA拷贝数变异CNV检测——基础概念篇

    一、CNV简介    拷贝数异常(copy number variations, CNVs)是属于基因组结构变异(structuralvariation),根据大小可分为两个层次:显微水平(micros...